Pipistrellus pipistrellus, RADseq, genomic, introgression, character displacement.

Druhový komplex Pipistrellus pipistrellus představuje skupinu netopýrů s radiačním centrem v oblasti Mediteránu. Naše práce zahrnuje jedince z alopatrických ostrovních populací, ale také zástupce z kontinentálních sympatrických linií. Druhy této skupiny se morfologicky liší jen nepatrně, proto je lze označit jako kryptické. Z tohoto důvodu je pro popis fylogeografické struktury zcela nezbytné využívat jiné přístupy (genetické, genomické, bioakustické nebo ekologické). Jako vhodné se jeví využití a srovnání genetických neutrálních jaderných a mitochondriálních markerů spolu s celogenomovými daty.Detailnější náhled na populační struktury těchto druhů nám poskytlo využívání moderních genomických metod, naše studie se konkrétně opírá o přístup RADseq. Získali jsme tak informace o ca 115 000 lokusů. Předběžné analýzy několika tisíc SNP, které se opírají o dostatečně spolehlivou hodnotu coverage, potvrzují vysokou míru diferenciace zejména u ostrovních populací. Zároveň nám tato komplexní data umožňují popsat evoluční mechanismy a tlaky, které byly na tyto populace v historii vyvíjeny. Předchozí výsledky, které vycházejí pouze z klasické genetiky, nám poskytly cenné, ale pouze omezené informace o výskytu možných introgresí. Celogenomová data poskytla mnohem přesnější pohled na populační strukturu u ostrovních populací a poukázala na možný výskyt introgresí právě u těchto populací. Komplikované evoluční události a nerovnoměrná výměna genů hraje také zřejmě důležitou roli ve speciaci a adaptivní radiaci u tohoto komplexu. Celkový pohled na druhový komplex odhaluje mozaikovitou strukturu ostrovních populací a vysoký sympatrický překryv u kontinentálních siblingů, tento fakt je zřejmě spojen s poměrně recentní expanzí s mikroevolučními důsledky jako je např. reinforcement a sympatrický posun znaků.

The Pipistrellus pipistrellus species complex is a group of bats with a radiation center in the Mediterranean region. Our work includes individuals from allopatric island populations, as well as representatives from continental sympatric lines. Species of this group are slightly different in terms of morphology, so they can be called cryptic. For this reason, other approaches (genetic, genomic, bioacoustic or ecological) are indispensable for describing the phylogeographic structure. Appropriate use and comparison of genetically neutral nuclear and mitochondrial markers together with whole genomic data appears. A more detailed look at the population structures of these species has provided us with the use of modern genomic methods, our study is specifically based on the RADseq approach. We obtained informations about 115,000 loci. Preliminary analyzes of several thousand SNPs, based on a sufficiently reliable coverage value, confirm a high degree of differentiation, especially for island populations. At the same time, these comprehensive data allow us to describe the evolutionary mechanisms and pressures that have been developed in these populations in history. Previous results, which are based only on classical genetics, have provided valuable, but limited, information on the occurrence of possible introgressions. Whole genomic data provided a much more accurate view of the population structure of island populations and pointed to the possible occurrence of introgression in these populations. Complicated evolutionary events and unequal gene replacement also play an important role in speciation and adaptive radiation in this complex. The overall view of the species complex reveals the mosaic structure of island populations and the high sympatric overlap in continental sibling, which is probably associated with a relatively recent expansion with microevolutionary consequences such as reinforcement and character displacement.