OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra biologie a ekologie (31700)
Název * : Complex Analyses of Short Inverted Repeats in All Sequenced Chloroplast DNAs
Citace : Brázda, V., Lýsek, J., Bartas, M. a Fojta, M. Complex Analyses of Short Inverted Repeats in All Sequenced Chloroplast DNAs. BioMed research international. 2018, 2018(24 July 2018), s. 1-10. ISSN 23146133.
Podnázev :
Rok * : 2018
Obor * :
Kód ISSN * : 2314-6133
Oficiální název periodika * : BioMed research international
Stát vydavatele periodika * : Spojené státy americké
Svazek periodika * : 2018
Číslo periodika v rámci svazku * : 24 July 2018
Číslo článku :
Ročník :
Počet stran článku * : 10
Strana od * : 1
Strana do * : 10
Kód UT WoS : 000439627100001
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
inverted repeats; chloroplast; DNA; bioinformatics
Popis v původním jazyce * :
Chloroplasts are key organelles in the management of oxygen in algae and plants and are therefore crucial for all living beings that consume oxygen. Chloroplasts typically contain a circular DNA molecule with nucleus-independent replication and heredity. Using “palindrome analyser” we performed complete analyses of short inverted repeats (S-IRs) in all chloroplast DNAs (cpDNAs) available fromthe NCBI genome database. Our results provide basic parameters of cpDNAs including comparative information on localization, frequency, and differences in S-IR presence. In a total of 2,565 cpDNA sequences available, the average frequency of S-IRs in cpDNA genomes is 45 S-IRs/per kbp, significantly higher than that found in mitochondrialDNA sequences.The frequency of S-IRs in cpDNAs generally decreased with S-IR length, but not for S-IRs 15, 22, 24, or 27 bp long, which are significantly more abundant than S-IRs with other lengths. These results point to the importance of specific S-IRs in cpDNA genomes. Moreover, comparison by Levenshtein distance of S-IR similarities showed that a limited number of S-IR sequences are shared in the majority of cpDNAs. S-IRs are not located randomly in cpDNAs, but are length-dependently enriched in specific locations, including the repeat region, stem, introns, and tRNA regions. The highest enrichment was found for 12 bp and longer S-IRs in the stem-loop region followed by 12 bp and longer S-IRs located before the repeat region. On the other hand, S-IRs are relatively rare in rRNA sequences and around introns.These data show nonrandom and conserved arrangements of S-IRs in chloroplast genomes.
Popis v anglickém jazyce * :
Typ zdroje financování výsledku * : Specifický výzkum
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01: RIV/61988987:17310/18:A1901WIB

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
  • Ing. Lucie Svitaneková (phone: +420 597 091 108, phone flap for UO: 1108)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}