OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra biologie a ekologie (31700)
Název * : Trypanosomatid mitochondrial RNA editing: dramatically complex transcript repertoires revealed with a dedicated mapping tool
Citace : Gerasimov, E., Gasparyan, A. A., Kaurov, I., Tichý, B., Logacheva, M. D., Kolesnikov, A. A., Lukeš, J., Yurchenko, V., Zimmer, S. a Flegontov, P. Trypanosomatid mitochondrial RNA editing: dramatically complex transcript repertoires revealed with a dedicated mapping tool. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2018, 46(2), s. 765-781. ISSN 0305-1048.
Podnázev :
Rok * : 2018
Obor * :
Kód ISSN * : 0305-1048
Oficiální název periodika * : NUCLEIC ACIDS RESEARCH
Stát vydavatele periodika * : Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Svazek periodika * : 46
Číslo periodika v rámci svazku * : 2
Číslo článku :
Ročník :
Počet stran článku * : 17
Strana od * : 765
Strana do * : 781
Kód UT WoS : 000423812300027
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
AUG INITIATION CODONS; MESSENGER-RNA; INSECT TRYPANOSOMATIDS; LEISHMANIA-TARENTOLAE; LEPTOMONAS-PYRRHOCORIS; CRITHIDIA-FASCICULATA; GENE-EXPRESSION; BRUCEI; EVOLUTION; CRYPTOGENE
Popis v původním jazyce * :
RNA editing by targeted insertion and deletion of uridine is crucial to generate translatable mRNAs from the cryptogenes of the mitochondrial genome of kinetoplastids. This type of editing consists of a stepwise cascade of reactions generally proceeding from 3' to 5' on a transcript, resulting in a population of partially edited as well as pre-edited and completely edited molecules for each mitochondrial cryptogene of these protozoans. Often, the number of uridines inserted and deleted exceed the number of nucleotides that are genome-encoded. Thus, analysis of kinetoplastid mitochondrial transcriptomes has proven frustratingly complex. Here we present our analysis of Leptomonas pyrrhocoris mitochondrial cDNA deep sequencing reads using T-Aligner, our new tool which allows comprehensive characterization of RNA editing, not relying on targeted transcript amplification and on prior knowledge of final edited products. T-Aligner implements a pipeline of read mapping, visualization of all editing states and their coverage, and assembly of canonical and alternative translatable mRNAs. We also assess T-Aligner functionality on a more challenging deep sequencing read input from Trypanosoma cruzi. The analysis reveals that transcripts of cryptogenes of both species undergo very complex editing that includes the formation of alternative open reading frames and whole categories of truncated editing products.
Popis v anglickém jazyce * :
Typ zdroje financování výsledku * : Projekty CEP/Záměry CEZ
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01: RIV/61988987:17310/18:A1901WG5

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
  • Ing. Lucie Svitaneková (phone: +420 597 091 108, phone flap for UO: 1108)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}