OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra interních oborů (11300)
Název * : Whole genome amplification effect on segmental copy-number changes and copy-number neutral loss of heterozygosity analysis by oligonucleotide-based array-comparative genomic hybridization in human myeloma cell line
Citace : Mikulášová, A., Smetana, J., Wayhelová, M., Janyskova, H., Okubote, S. A., Hájek, R. a Kuglik, P. Whole genome amplification effect on segmental copy-number changes and copy-number neutral loss of heterozygosity analysis by oligonucleotide-based array-comparative genomic hybridization in human myeloma cell line. INTERNATIONAL JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY. 2016, roč. 9, s. 65-69. ISSN 1936-2625.
Podnázev :
Rok * : 2016
Obor * : Onkologie a hematologie
Kód ISSN * : 1936-2625
Oficiální název periodika * : INTERNATIONAL JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY
Stát vydavatele periodika * : Spojené státy americké
Svazek periodika * : Neuveden
Číslo periodika v rámci svazku * : 7
Číslo článku :
Ročník : 9
Počet stran článku * : 5
Strana od * : 65
Strana do * : 69
Kód UT WoS : 000381729200036
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
Whole genome amplification; array-comparative genomic hybridization; copy-number changes; copy-number neutral loss of heterozygosity; genotyping
Popis v původním jazyce * :
Whole genome amplification (WGA) is an approach designed to overcome small amounts of DNA for genome-wide genetic tests used in many clinical applications. Various strategies of WGA have been developed; however, none of them can guarantee the absence of amplification bias. In this study, a total of four multiple displacement amplification (MDA)-based and two PCR-based WGA kits were compared in their effect on segmental copy-number (CN) changes and copy-number neutral loss of heterozygosity (cnnLOH) detection by three microarray platforms: CGH/4x44K (Agilent), CGH+SNP/4x180K (Agilent) and CGH+SNP/4x180K (OGT). Genomic imbalances-rich myeloma cell line U266 was used as material. The main outcomes are as follows: 1) MDA-based WGAs showed higher tendency to generate false positive imbalances in contrast to PCR-based WGAs with higher risk of false negativity; 2) the specific risk of false positivity and/or negativity increased with decreasing CN segments size; 3) single-cell WGAs showed significantly worse effect on results in comparison to WGAs with nanogram level of DNA as input; 4) PCR-based WGAs were incompatible with cnnLOH analysis based on SNP in restriction digestion sites and also showed higher risk of cnnLOH false negativity when combined with analysis based on simple hybridization. In conclusion, the results of this study help to choose WGA according to individual user requirements and options. Moreover, we have shown a strategy to verify and validate segmental CN changes detection by DNA array protocol including any WGA for any purpose to attain the highest efficiency without an unnecessary WGA bias.
Popis v anglickém jazyce * :
Typ zdroje financování výsledku * : Jiné veřejné zdroje
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01: RIV/61988987:17110/16:A1701LEA

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
  • Ing. Lucie Svitaneková (phone: +420 597 091 108, phone flap for UO: 1108)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}