OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra biologie a ekologie (31700)
Název * : Isolation and Characterization of Simple Sequence Repeats (SSR) Markers from the Moss Genus Orthotrichum Using a Small Throughput Pyrosequencing Machine
Citace : Sawicki, J., Kwaśniewski, M., Szczecińska, M., Chwiałkowska, K., Milewicz, M. a Plášek, V. Isolation and Characterization of Simple Sequence Repeats (SSR) Markers from the Moss Genus Orthotrichum Using a Small Throughput Pyrosequencing Machine. INT J MOL SCI. 2012, roč. 13, s. 7586-7593. ISSN 1422-0067.
Podnázev :
Rok * : 2012
Obor * : Botanika
Kód ISSN * : 1422-0067
Oficiální název periodika * : INT J MOL SCI
Stát vydavatele periodika * : Švýcarská konfederace
Svazek periodika * : Neuveden
Číslo periodika v rámci svazku * : 6
Číslo článku :
Ročník : 13
Počet stran článku * : 8
Strana od * : 7586
Strana do * : 7593
Kód UT WoS :
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
SSR markers; Orthotrichum; 454 pyrosequencing
Popis v původním jazyce * :
Here, we report the results of next-generation sequencing on the GS Junior system to identify a large number of microsatellites from the epiphytic moss Orthotrichum speciosum. Using a combination of a total (non-enrichment) genomic library and small-scale 454 pyrosequencing, we determined 5382 contigs whose length ranged from 103 to 5445 bp. In this dataset we identified 92 SSR (simple sequence repeats) motifs in 89 contigs. Forty-six of these had flanking regions suitable for primer design. We tested PCR amplification, reproducibility, and the level of polymorphism of 46 primer pairs for Orthotrichum speciosum using 40 individuals from two populations. As a result, the designed primers revealed 35 polymorphic loci with more than two alleles detected. This method is cost- and time-effective in comparison with traditional approaches involving cloning and sequencing.
Popis v anglickém jazyce * :
Here, we report the results of next-generation sequencing on the GS Junior system to identify a large number of microsatellites from the epiphytic moss Orthotrichum speciosum. Using a combination of a total (non-enrichment) genomic library and small-scale 454 pyrosequencing, we determined 5382 contigs whose length ranged from 103 to 5445 bp. In this dataset we identified 92 SSR (simple sequence repeats) motifs in 89 contigs. Forty-six of these had flanking regions suitable for primer design. We tested PCR amplification, reproducibility, and the level of polymorphism of 46 primer pairs for Orthotrichum speciosum using 40 individuals from two populations. As a result, the designed primers revealed 35 polymorphic loci with more than two alleles detected. This method is cost- and time-effective in comparison with traditional approaches involving cloning and sequencing.
Typ zdroje financování výsledku * : Projekty CEP/Záměry CEZ
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01: RIV/61988987:17310/12:A13014QT

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}