OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra biologie a ekologie (31700)
Název * : Unheeded SARS-CoV-2 proteins? A deep look into negative-sense RNA
Citace : Bartas, M., Volná, A., Beaudoin, C. A., Poulsen, E. T., Červeň, J., Brázda, V., Špunda, V., Blundell, T. L. a Pečinka, P. Unheeded SARS-CoV-2 proteins? A deep look into negative-sense RNA. Briefings in Bioinformatics. 2022, č. March, s. 1-10. ISSN 1467-5463.
Podnázev :
Rok * : 2022
Obor * : Mikrobiologie, virologie
Kód ISSN * : 1467-5463
Oficiální název periodika * : Briefings in Bioinformatics
Stát vydavatele periodika * : Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Svazek periodika * : Neuveden
Číslo periodika v rámci svazku * : March
Číslo článku : bbac045
Ročník :
Počet stran článku * : 10
Strana od * : 1
Strana do * : 10
Kód UT WoS : 000762456600001
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
SARS-CoV-2, RNA, ORFs, Kozak sequence, proteomics, structures
Popis v původním jazyce * :
SARS-CoV-2 is a novel positive-sense single-stranded RNA virus from the Coronaviridae family (genus Betacoronavirus), which has been established as causing the COVID-19 pandemic. The genome of SARS-CoV-2 is one of the largest among known RNA viruses, comprising of at least 26 known protein-coding loci. Studies thus far have outlined the coding capacity of the positive-sense strand of the SARS-CoV-2 genome, which can be used directly for protein translation. However, it has been recently shown that transcribed negative-sense viral RNA intermediates that arise during viral genome replication from positive-sense viruses can also code for proteins. No studies have yet explored the potential for negative-sense SARS-CoV-2 RNA intermediates to contain protein-coding loci. Thus, using sequence and structure-based bioinformatics methodologies, we have investigated the presence and validity of putative negative-sense ORFs (nsORFs) in the SARS-CoV-2 genome. Nine nsORFs were discovered to contain strong eukaryotic translation initiation signals and high codon adaptability scores, and several of the nsORFs were predicted to interact with RNA-binding proteins. Evolutionary conservation analyses indicated that some of the nsORFs are deeply conserved among related coronaviruses. Three-dimensional protein modeling revealed the presence of higher order folding among all putative SARS-CoV-2 nsORFs, and subsequent structural mimicry analyses suggest similarity of the nsORFs to DNA/RNA-binding proteins and proteins involved in immune signaling pathways. Altogether, these results suggest the potential existence of still undescribed SARS-CoV-2 proteins, which may play an important role in the viral lifecycle and COVID-19 pathogenesis.
Popis v anglickém jazyce * :
Typ zdroje financování výsledku * :
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01:

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
  • Ing. Lucie Svitaneková (phone: +420 597 091 108, phone flap for UO: 1108)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}