OU Portal
  • Log In
  • Welcome
  • Applicants
Z6_60GI02O0O8IDC0QEJUJ26TJDI4
{}

Pomocí tohoto dialogu můžete vyhledat domácí autory, čili autory, kteří jsou vedeni v personálních systémech Ostravské univerzity.

Do našeptávače níže napište hledaný text a tento text bude vyhledán ve jméně nebo příjmení autora. Autoři, kteří budou hledanému textu odpovídat, Vám budou nabídnuti v seznamu. Pomocí myši nebo šipek na klávesnici vyberte požadovaného autora.

Našeptávač : 
Přidat autora k záznamu Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu přidat cizího autora, čili autora, který nemá žádný pracovní ani studijní vztah k Ostravské univerzitě. Takto přidaný autor bude do RIV vykázán jako nedomácí.

Pro přidání autora vepište jeho jméno a příjmení do určených položek.

Jméno :
Příjmení :
Přidat k záznamu Zavřít
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete k záznamu nahrát soubor PDF. Tento soubor musí obsahovat text tohoto záznamu (text článku, knihy, atd.). Tento soubor je důležitý pro RIV, protože může být použit jako důkaz existence tohoto záznamu.

Pro nahrání souboru klikněte na tlačítko Browse a vyberte soubor, který chcete nahrát. Nahrávání souboru zahájíte tlačítkem Nahrát soubor.

Maximální velikost souboru PDF je omezena na 100 MB.

Soubor : 

Nahrát soubor
Zavřít

Pomocí tohoto dialogu můžete stáhnout PDF soubor přiřazený tomuto záznamu. Pro stažení souboru klikněte níže na název tohoto souboru a bude Vám nabídnuta možnost soubor uložit.

Věnujte prosím pozornost také velikosti PDF souboru. Velké soubory se mohou stahovat delší dobu, pokud máte pomalé internetové připojení.

Název souboru :
Velikost souboru :
Zavřít
Publikační činnost


preloading...   Probíhá načítání, čekejte prosím...
publicationId :
tempRecordId :
actionDispatchIndex :
navigationBranch :
pageMode :
tabSelected :
isRivValid :
Typ záznamu * : článek v odborném periodiku (J)
Domácí pracoviště * : Katedra biologie a ekologie (31700)
Název * : Global analysis of inverted repeat sequences in human gene promoters reveals their non-random distribution and association with speci fic biological pathways
Citace : Brázda, V., Bartas, M., Lýsek, J., Coufal, J. a Fojta, M. Global analysis of inverted repeat sequences in human gene promoters reveals their non-random distribution and association with speci fic biological pathways. Genomics. 2020, 112(4), s. 2772-2777. ISSN 0888-7543.
Podnázev :
Rok * : 2020
Obor * :
Kód ISSN * : 0888-7543
Oficiální název periodika * : Genomics
Stát vydavatele periodika * : Spojené státy americké
Svazek periodika * : 112
Číslo periodika v rámci svazku * : 4
Číslo článku :
Ročník :
Počet stran článku * : 6
Strana od * : 2772
Strana do * : 2777
Kód UT WoS : 000534479700011
EID :
Poddruh recenzovaného článku : Článek v impaktovaném časopise (Jimp)
Klíčová slova anglicky * :
Inverted repeat; Promoter; Human; Genome; Distribution
Popis v původním jazyce * :
Inverted repeats (IR) play important roles in specific DNA-dependent processes in simple prokaryotes to complex eukaryotes. They are recognized by a variety of proteins including restriction enzymes, helicases and transcription factors. We evaluate the presence and localization of IRs in all validated human promoter sequences within 1000 bp upstream and downstream of the transcription start site (TSS). The occurrence of 7 bp and longer IRs is located non-randomly in promoter regions, with enrichment within 200 bp upstream of the TSS. The highest frequency of IRs is just before TSS for repeats of 8 bp or longer. A comparison of promoters divided according to the occurrence of five individual promoter motifs shows unique location patterns of IRs. Principal component analyses and hierarchical clustering of IRs abundance demonstrated that they are depleted and/or not enriched in the promoters of stably expressed genes, but show significant enrichments for specific dynamically regulated biological pathways.
Popis v anglickém jazyce * :
Inverted repeats (IR) play important roles in specific DNA-dependent processes in simple prokaryotes to complex eukaryotes. They are recognized by a variety of proteins including restriction enzymes, helicases and transcription factors. We evaluate the presence and localization of IRs in all validated human promoter sequences within 1000 bp upstream and downstream of the transcription start site (TSS). The occurrence of 7 bp and longer IRs is located non-randomly in promoter regions, with enrichment within 200 bp upstream of the TSS. The highest frequency of IRs is just before TSS for repeats of 8 bp or longer. A comparison of promoters divided according to the occurrence of five individual promoter motifs shows unique location patterns of IRs. Principal component analyses and hierarchical clustering of IRs abundance demonstrated that they are depleted and/or not enriched in the promoters of stably expressed genes, but show significant enrichments for specific dynamically regulated biological pathways.
Typ zdroje financování výsledku * : Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace
Seznam projektů :
ID Projektu Název projektu
Seznam ohlasů : 
Ohlas
R01: RIV/61988987:17310/20:A21027WP

© 2019 Centre for Information Technology

  • Technická podpora :
  • Mgr. Olga Blahutová (phone: +420 597 091 129, phone flap for UO: 1129)
  • Ing. Lucie Svitaneková (phone: +420 597 091 108, phone flap for UO: 1108)
Complementary Content
  • ${title}${badge}
${loading}